Οι οίνοι ΠΓΕ Περιφερειακών Ενοτήτων, περιορίζονται στα γεωγραφικά όρια μιας περιφερειακής ενότητας, δηλαδή ενός συγκεκριμένου πρώην νομού της. Τα σταφύλια των οίνων ΠΓΕ Περιφερειακών Ενοτήτων πρέπει να προέρχονται από αυτή την περιφερική ενότητα, κάτι που ισχύει και για την οινοποίησή τους. Στο επίπεδο των οίνων ΠΓΕ Περιφερειακών Ενοτήτων οι ποικιλιακές συνθέσεις είναι ακόμα πιο αυστηρές κατά βάση, ενώ πιο περιορισμένοι είναι και οι τύποι οίνων που μπορούν να παραχθούν. Παρ' όλα αυτά, στο συγκεκριμένο επίπεδο των οίνων ΠΓΕ, δικαίωμα παραγωγής έχουν και τα οινοποιεία όμορων περιφερειακών ενοτήτων.
Οι οίνοι ΠΓΕ Περιφερειακών Ενοτήτων που έχουν θεσμοθετηθεί είναι οι:
- ΠΓΕ Αργολίδα
- ΠΓΕ Αρκαδία
- ΠΓΕ Αττική
- ΠΓΕ Αχαΐα
- ΠΓΕ Γρεβενά
- ΠΓΕ Δράμα
- ΠΓΕ Δωδεκάνησα
- ΠΓΕ Έβρος
- ΠΓΕ Εύβοια
- ΠΓΕ Ζάκυνθος
- ΠΓΕ Ηλεία
- ΠΓΕ Ημαθία
- ΠΓΕ Ηράκλειο
- ΠΓΕ Θάσος
- ΠΓΕ Θεσσαλονίκη
- ΠΓΕ Ιωάννινα
- ΠΓΕ Καβάλα
- ΠΓΕ Καρδίτσα
- ΠΓΕ Καστοριά
- ΠΓΕ Κέρκυρα
- ΠΓΕ Κοζάνη
- ΠΓΕ Κορινθία
- ΠΓΕ Κυκλάδες
- ΠΓΕ Λακωνία
- ΠΓΕ Λασίθι
- ΠΓΕ Λέσβος
- ΠΓΕ Λευκάδα
- ΠΓΕ Μαγνησία
- ΠΓΕ Μεσσηνία
- ΠΓΕ Πέλλα
- ΠΓΕ Πιερία
- ΠΓΕ Ρέθυμνο
- ΠΓΕ Σέρρες
- ΠΓΕ Φλώρινα
- ΠΓΕ Χανιά
- ΠΓΕ Χαλκιδική
- ΠΓΕ Χίος